相続人となるはずだった妹さんが亡くなっていましたが、妹さんには息子さん（被相続人の孫）がいるので、妹さんの相続権は息子さんに引き継がれます。
　このように、本来相続人となるはずだった被相続人の子または兄弟が、相続が開始される以前に亡くなっていた場合、その人の相続権は子が引き継ぐことができます。
　これを代襲相続と言います。
　本件は、代襲相続によって妹さんの息子さんに相続権が引き継がれているので、彼と遺産分割協議をすることになります。